W kolejnych latach Geronimo prowadził regularne rajdy do Meksyku i był obecny podczas incydentu Bascom (1861) i bitwy pod Apache Pass (1862), które były początkiem wojen Apaczów z USA. Po tym, jak Mangas Coloradas został schwytany i stracony przez armię USA w 1863 roku, Geronimo wziął udział w wojnie zemsty swojego zięcia Cochise przeciwko amerykańskim osadnikom i górnikom w Arizonie i Nowym Meksyku (1863-1872).

Jednak w 1875 roku wszystkie plemiona Apaczów zostały przesiedlone do znacznie mniejszego pojedynczego rezerwatu, San Carlos , nazywanego "Hell's Forty Acres", na nieproduktywnej ziemi na skalistej pustyni. Chociaż oczekiwano, że Apacze będą się utrzymywać z rolnictwa, ziemia im dana była zbyt nieproduktywna do tego celu. Życie w przeludnionym rezerwacie było dotknięte głodem, chorobami (takimi jak ospa i malaria) i sporami międzyplemiennymi, pogarszanymi przez korupcję lokalnych amerykańskich handlarzy, którzy pobierali wygórowane ceny od Indian, oraz agentów ds. Indian, którzy rutynowo niewłaściwie zarządzali funduszami rządowymi przydzielanymi w celu pomocy Indianom w osiedleniu się w nowym, rolniczym stylu życia.

W 1876 roku Geronimo i część jego zwolenników po raz pierwszy uciekła z rezerwatu i udała się do Meksyku, ale zostali schwytani w marcu 1877 roku, kiedy wrócili ze stadem skradzionych koni i siłą wrócili do San Carlos. Geronimo pozostał w rezerwacie do 1881 roku, nie biorąc udziału w wojnie Victorio (1879-1880).

Jednak po tym, jak armia amerykańska zaczęła aresztować wybitnych wojowników Apaczów po incydencie w Cibecue Creek (wrzesień 1881), Geronimo uciekł w góry Siera Madre w Meksyku z około 70 wojownikami. W Meksyku Geronimo dołączył do grupy Nany i przez dwa lata z około 80 wojownikami napadał na farmy i rancza po obu stronach granicy. W 1883 roku Apacze napadli na obóz górniczy w Arizonie i zabili sędziego w Nowym Meksyku.

Gdy najazdy Apaczów w USA zostały wznowione, rząd USA mianował generała George'a Crooka dowódcą wojskowym w Arizonie. Generał Crook wypróbował oryginalne podejście - poprawę warunków życia w rezerwacie San Carlos, zatrudniając zwiadowców Apaczów w rezerwacie do walki z renegatami Apaczów i współpracując z meksykańskimi władzami po drugiej stronie granicy. Te środki przyniosły natychmiastowe rezultaty - armia Crooka składająca się tylko z 42 amerykańskich kawalerzystów i 193 zwiadowców Apaczów przekroczyła granicę z Meksykiem w maju 1883 r. i pomyślnie odnalazła grupę Geronimo w górach Siera Madre. Zaatakowany w swojej kryjówce, chociaż stracił tylko kilku wojowników, Geronimo zgodził się spotkać z Crookiem i poddać się. Napastnicy przybyli do San Carlos w marcu 1884 r. i przez jakiś czas żyli w pokoju.

Pewnej nocy w maju 1885 roku Geronimo upił się z kilkoma innymi wodzami; jednak spożywanie alkoholu przez Indian z rezerwatu było nielegalne. Obawiając się odwetu, Geronimo ponownie uciekł do Meksyku z około 130 zwolennikami. Generał Crook wysłał swoje siły w pościg, składające się z około 3000 ludzi, w tym 200 zwiadowców Apaczów, ale Apacze byli nieuchwytnym wrogiem, uciekając przed jednostkami armii i atakując rancza i gospodarstwa. Zimą 1885-1886 roku siły amerykańskie uparcie polowały na Geronimo w Sierra Madre, ale z niewielkim powodzeniem. W marcu 1886 roku Geronimo poddał się generałowi Crookowi, ale zanim siły amerykańskie mogły go eskortować przez granicę, Geronimo złamał słowo i uciekł z 20 wojownikami i 18 obozowymi zwolennikami. Crook został ostro skrytykowany w Waszyngtonie za niepowodzenie w schwytaniu Geronimo, a także za strategię negocjacji z Indianami i wykorzystanie zwiadowców Apaczów do walki z Apaczami. 1 kwietnia 1886 r. Crook został zwolniony ze stanowiska i zastąpiony przez generała Nelsona Milesa , który pokonał Indian w wojnie Nez Perce (1877).

Pierwszym działaniem Milesa było przeniesienie wszystkich Apaczów (w tym wojskowych zwiadowców Crook) na Florydę, aby pozbawić Geronimo źródła siły roboczej i wsparcia w Arizonie. Po drugie, nakazał zbudowanie heliografów wzdłuż granicy, aby szybko uzyskać informacje o najazdach Apaczów i rozmieścić około 5000 żołnierzy w małych oddziałach, aby szybko odpowiedzieć na każdy atak Apaczów. Jednak wszystkie te wysiłki nie przyniosły rezultatów, ponieważ najeźdźcy Apaczów skutecznie zastosowali taktykę uderz i uciekaj na rozległych terytoriach - zaatakowali ranczo w Arizonie, a następnie miasto Nogales kilka dni później, bez żadnych strat po swojej stronie. Nie mając nic do pokazania w zamian za ogromne zasoby, w sierpniu 1886 roku generał Miles został zmuszony do negocjacji. Geronimo spotkał się ze swoim wysłannikiem, porucznikiem Gatewoodem, i dowiedział się, że jego rodzina i cały lud zostali zesłani na Florydę z powodu jego nieposłuszeństwa. Wiadomość ta złamała wolę walki Geronima i we wrześniu 1886 roku poddał się po raz ostatni generałowi Milesowi.

Grupa Geronimo zabiła 17 amerykańskich cywilów uciekając w kierunku granicy z Meksykiem w maju 1885 roku. ^{[ potrzebne źródło ]}

Podczas rajdu Ulzany, który miał miejsce od 23 listopada do końca 1885 roku, 12 Apaczów pod wodzą Ulzany przemierzyło dystans 1200 mil (1931 km), zabiło 38 osób i schwytało 250 sztuk bydła, zabijając tylko jedną osobę.

Podczas kampanii Crooka, w sierpniu 1885 r. pojmano 20 kobiet i dzieci, w grudniu 1885 r. podczas rajdu Ulzany zginął jeden wojownik , a w marcu 1886 r. poddało się 20 wojowników i 60 cywilów. ^{[ potrzebne źródło ]}

Podczas kampanii Milesa, we wrześniu 1886 roku poddało się 18 wojowników, 12 kobiet i 6 dzieci, a 400 pokojowo nastawionych Apaczów z rezerwatu San Carlos , w tym zwiadowcy Apaczów , zostało deportowanych na Florydę